Рацион манулов включает в себя некоторых грызунов, птиц и насекомых, но в большинстве своем его составляют пищухи — мелкие зайцеобразные. Регулируя их численность и съедая до пяти зверьков в день, манул предотвращает деградацию пастбищ и сдерживает распространение природных инфекций. Таким образом манул косвенно поддерживает биоразнообразие и сохраняет среду обитания для множества других видов растений и животных.
Однако сегодня этот природный баланс находится под угрозой: из-за превращений степей в пашни, опустошительных пожаров и агрессивного применения химических средств манул стремительно теряет и дом, и возможность добывать пищу.
Ситуацию усугубляет человеческий фактор: хотя мех манула не имеет высокой ценности, браконьеры всё равно истребляют животных ради трофеев, а в некоторых случаях — ради употребления мяса в пищу. Кроме того, коты часто гибнут в капканах, расставленных на других зверей, и сталкиваются с жесткой конкуренцией со стороны естественных врагов — лисиц, волков и снежных барсов.
Несмотря на то, что манул занесен в Красную книгу России как редкий вид с сокращающейся численностью, системного мониторинга его численности в стране не ведется более десяти лет, поэтому точных данных о популяции нет.